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单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训培训班通知
点击次数:8128 发布日期:2019-9-19  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
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各有关单位:
随着新一代单细胞测序技术的快速发展,在准确度大大提高的前提下,?进一步降低测序成本。由此不断产生出巨量的分子bck体育app怎么下载学数据,这些数据有着数量巨大、关系复杂的特点,以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分析。随着bck体育app怎么下载信息学作为新兴学科迅速蓬勃发展,正在改变人们研究bck体育app怎么下载医学的传统方式,单细胞技术以及数据分析技术已成为探索bck体育app怎么下载学底层机制和研究人类复杂疾病诊断、治疗及预后的重要工具,广泛应用于生命科学各个领域,是21世纪生命科学与bck体育app怎么下载技术的重要战略前沿和主要突破口。为进一步推动我国bck体育app怎么下载信息学特别是单细胞测序的发展,提高从业人员的技术水平,由中科成创(北京)bck体育app怎么下载技术有限公司举办“单细胞测序分析及单细胞转录组上机实训”培训班具体事宜通知如下:
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一、培训目标及特点:
本培训以单细胞测序技术的应用与数据分析、单细胞转录组为主题,精心设计了具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机课程。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流,能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路,在研究技术方面领悟更多。
二、培训对象:
大中专院校bck体育app怎么下载信息、bck体育app怎么下载计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事bck体育app怎么下载、生命科学、微bck体育app怎么下载研究的相关人员;bck体育app怎么下载、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点:2019年11月15日——11月18日?? ?湖北武汉
(时间安排:第1天报到,授课3天)
四、授课专家:
主讲专家来自中科院科研机构的高级专家,拥有丰富的科研工作经验,长期从事bck体育app怎么下载信息学方面的项目研究,发表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等杂志40多篇。具有资深的技术底蕴和专业背景,目前承担国家科技部、国家自然基金委和市科技新星项目等多项课题。
五丶培训内容:
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单细胞测序技术与应用
1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。
2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。
3. 近年单细胞方向高分文章思路解析。
4. 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。
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Linux及R语言入门与实操
1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
2. R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。
3. R语言语法介绍及常用命令。
4. 数据处理功能及统计应用。
5. R语言画图实操。
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单细胞转录组数据分析思路及流程
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1. 单细胞实验处理、建库及测序。
2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。
3. 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。
4. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微bck体育app怎么下载等领域的研究内容及思路。
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单细胞转录组数据分析实操
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1. 常规单细胞组学数据比对。
2. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。
3. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。
4. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。
5. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。
6. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。
多组学整合分析和结果解读
1. 转录组,基因组,表观分析介绍。
2. RNA和 ATAC-seq等多组学整合分析。
3. 常规10X单细胞ATAC数据测序原理简介、分析流程介绍。
4. 单细胞免疫组库测序技术及应用。
5. 组学分析常用数据库介绍及使用。
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单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操
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1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。
2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
3. 通过SCENIC软件进行转录因子预测分析。
4. tSNE,小提琴图,热图,网络图,GO、KEGG富集图,GSEA等图形绘制。
六、报名办法及费用:?
每人¥4300(含报名费、培训费、资料费、上机费)
团队报名:4+1优惠。(5位其中1位免除费用)
所报名参加学员赠送一个8G U盘(内含上课所有使用软件与课件资料)
食宿可统一安排,费用自理。各单位人员报名参加,报名回执表请回传至会务处即可。
如单位有内训需求,请将内训方案传至会务组,根据单位需求安排相应专家进行授课
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七、 联系方式:?????????????????????????????????
联系人:张琦 177 4456 9660????????????????????????
报名邮箱:zkcc_BIS@vip.163.com ???????
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中科成创(北京)bck体育app怎么下载技术有限公司
二零一九年九月十八日
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参考附件:报名回执表.doc?
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